https://www.data.gouv.fr/en/datasets/donnees-de-laboratoires-infra-departementales-durant-lepidemie-covid-19/ - Mouve

Site d'origine

Données de laboratoires infra-départementales durant l'épidémie COVID-19 SI-DEP

This dataset comes from a certified public service

Point d'attention : les difficultés de remontée des résultats de tests vers Santé publique France ont été progressivement résolues entre le 5 et le 7 novembre. À ce jour, l’ensemble des résultats sont disponibles selon les délais de consolidation habituels

Les actions de Santé publique France

Santé publique France a pour mission d'améliorer et de protéger la santé des populations. Durant la crise sanitaire liée à l'épidémie du COVID-19, Santé publique France se charge de surveiller et comprendre la dynamique de l'épidémie, d'anticiper les différents scénarii et de mettre en place des actions pour prévenir et limiter la transmission de ce virus sur le territoire national.

Le Système d’Informations de DEPistage (SI-DEP)

Les indicateurs de surveillance virologique sont issus du système d’information de dépistage (SI-DEP), dont l’objectif est de remonter les données de tests (RT-PCR) réalisés par l’ensemble des laboratoires de ville et établissements hospitaliers concernant le SARS-COV2.

Le taux d'incidence sur 7 jours glissants correspond, au jour J, au nombre total de personnes testées positives dans l'intervalle de temps [J-9; J-3], divisé par le nombre d'habitants.

Description des données

Le présent jeu de données renseigne :

  • la classe du taux d'incidence tous âges sur 7 jours glissants ;
  • la classe du taux d'incidence pour les personnes âgées de plus de 65 ans sur 7 jours glissants ;
  • la classe du taux de dépistage tous âges sur 7 jours glissants ;
  • la classe du taux de dépistage pour les personnes âgées de plus de 65 ans sur 7 jours glissants ;
  • la classe du taux de positivité tous âges sur 7 jours glissants ;
  • la classe du taux de positivité pour les personnes âgées de plus de 65 ans sur 7 jours glissants.

Les taux exacts ne sont pas affichés afin d’éviter l’identification des personnes testées, notamment celles qui présentent un test positif.

Les données sont fournies à l'échelle :

  • EPCI ;
  • Commune ;
  • IRIS.

Le taux d'incidence correspond au nombre de tests positifs pour 100.000 habitants. Il est calculé de la manière suivante :

(100000 * nombre de cas positif) / Population.

Le taux de dépistage, aussi appelé capacité analytique, correspond au nombre de tests réalisés, qu'il soient positifs ou négatifs, pour 100.000 habitants. Il est calculé de la manière suivante :

(100000 * nombre de test réalisés) / Population.

Le taux de positivité correspond au nombre de tests positifs rapportés au nombre de tests réalisés. Il est calculé de la manière suivante : (100 * nombre de test positifs) / nombre de tests réalisés.

Précision :

  • Le taux d'incidence est calculé un jour J à partir des tests réalisés entre 3 et 9 jours précédemment. Pour les jours plus récents (J, J-1, J-2), un grand nombre de tests n'est pas encore rapporté (délai de collecte et de centralisation) ;
  • Si un patient a réalisé plusieurs tests positifs, la date de son premier test PCR est sélectionnée ;
  • À compter du 29/08, les indicateurs issus des données de laboratoires (SI-DEP) présentent des taux d’incidence, de positivité et de dépistage corrigés en fonction des dépistages réalisés dans les aéroports à l’arrivée des vols internationaux ;
  • Pour en savoir plus consultez la note méthodologique disponible dans les ressources.

Limites :

  • Seuls les tests biologiques des personnes pour lesquelles le département de résidence a pu être localisé sont identifiés. Les personnes dont le département n’a pas pu être remonté dans les données SIDEP ne sont comptabilisées qu'au niveau France entière. De ce fait la somme des tests indiqués dans les départements ou régions est inférieure au nombre de tests indiqué en France.
  • Le délai de remontée des tests peut excéder 9 jours dans certains cas. Les indicateurs sont ajustés quotidiennement selon la réception des résultats.

Resources

See also: community resources

Main file

Documentation

Note méthodologique échelons infra-départementaux

sidep-note-methodo-270820.pdf

faq-geodes-sidep-250920.pdf

Update

sg-iris-opendata-2020-12-09-15h17.csv

Community contributions

Explore with data.gouv.fr

Community resources

Archives de ce jeu de données sur opendatArchives

Add a community resource

You have built a more comprehensive database than those presented here? This is the time to share it!

Reuses

COVID-19_tests_virologiques

COVID-19_tests_virologiques

Cartographie interactive automatique des résultats des tests communiqués par les laboratoires , par EPCI et par département, comportant les représentations des évolutions d'une…
  • Application
  • 1
  • 0
  • 2020
  • Jean-Philippe Gautier
Intensité de répartition du COVID-19 en France Métropolitaine

Intensité de répartition du COVID-19 en France Métropolitaine

Cartographie à l'échelle IRIS du taux d'incidence de l'épidémie de COVID-19 en France Métropolitaine (mise à jour quotidienne) et intensité de la circulation du virus.
  • Visualization
  • 1
  • 0
  • 2020
  • Vianney Dugrain
Taux d'incidence, dépistage et positivité COVID par Commune sur une semaine glissante en France Métropolitaine

Taux d'incidence, dépistage et positivité COVID par Commune sur une semaine glissante en France Métropolitaine

Visualisation des taux d’incidence, dépistage et positivité COVID par commune sur une semaine glissante en France Métropolitaine en fonction du temps. Après avoir choisi une date…
  • Visualization
  • 1
  • 0
  • 2020
  • MGD
Observatoire GMS COVID-19

Observatoire GMS COVID-19

Global Map lance l’observatoire GMS COVID-19 qui permet de suivre l’évolution de la pandémie d’une semaine à l’autre au niveau infra-communal, sur la base des données publiées…
  • Post
  • 1
  • 0
  • 2020
  • global map
Cartographie COVID-19 au niveau infra-communal

Cartographie COVID-19 au niveau infra-communal

Découvrez en exclusivité la première cartographie liée au COVID-19 au niveau infra-communal. Ces informations sont issues des données publiées par Santé Publique France sur la…
  • Post
  • 1
  • 0
  • 2020
  • global map
Taux d'incidence, de dépistage et de positivité COVID par EPCI sur une semaine glissante en France Métropolitaine

Taux d'incidence, de dépistage et de positivité COVID par EPCI sur une semaine glissante en France Métropolitaine

Cartographie interactive en fonction du temps du suivi du taux d'incidence, du taux de dépistage et du taux de positivité COVID par EPCI sur une semaine. Le taux d'incidence sur…
  • Visualization
  • 1
  • 0
  • 2020
  • MGD
Taux d'incidence (<65ans) animation

Taux d'incidence (<65ans) animation

Taux d'incidence (<65ans) animation
  • Visualization
  • 1
  • 0
  • 2020
  • Pascal Schetelat
Visualisation de la classe de taux d'incidence

Visualisation de la classe de taux d'incidence

Visualisation de la classe de taux d'incidence
  • Visualization
  • 1
  • 0
  • 2020
  • Pascal Schetelat
+

Add a reuse

You reused these data and published an article, a computer graphics, or an application? It's time to let you know! Reference your work in just a few clicks and increase your visibility.

Discussions

Discussion between the organization and the community about this dataset.

Publish a dataset

Contribute and add a new dataset to this site catalog.

Publish a reuse

Contribute and add a new reuse to this site catalog.

Create or find your organization

You can create a new organization or find yours.

level de log mis à 1

Récupération du document https://www.data.gouv.fr/en/datasets/donnees-de-laboratoires-infra-departementales-durant-lepidemie-covid-19/.

Récupération de l'URL https://www.data.gouv.fr/en/datasets/donnees-de-laboratoires-infra-departementales-durant-lepidemie-covid-19/...

Raccourcis

Commandes

Fermer